うつ病と睡眠時無呼吸症候群は似ていて「日中の強い眠気」「集中力や判断力の低下」などの症状が共通しているため、症状だけでは区別が難しい。また両方の疾患を同時に発症するケースもある。

うつ病患者の33％が睡眠時無呼吸症候群を併発している。前述したとおり症状が似ているので併発に気づいていない人もいると考えられ実際の人数は更に多い可能性がある。